Proteine sind biologisch sehr wichtig, da sie die ausführenden Biomoleküle in Zellen, Geweben und Organen sind. Dabei umfasst die Proteomik die parallele Identifizierung, Quantifizierung und räumliche Auflösung vieler Proteine in komplexen Proben. Proteomik-Experimente mit Schwerpunkt auf der klinischen Forschung sind unverzichtbar für ein umfassendes Verständnis biologischer Funktionen und Krankheiten, die für alternde Gesellschaften von hoher sozioökonomischer Relevanz sind, wie neurodegenerative Erkrankungen, Stoffwechselkrankheiten und Krebs.
Die neu gegründete Core-Facility „CUBiMed.RUB“ an der Medizinischen Fakultät baut auf dem von 2014-2021 vom BMBF geförderten Projekt de.NBI-BioInfra.Prot auf. Mithilfe der Core-Facility kann das dort etablierte Angebot an Tools, Services und Trainings weitergeführt werden. Nach wie vor bestehen enge Kooperationen mit der europäischen Infrastruktur-Initiative ELIXIR.
Vor diesem Hintergrund verfügen die Mitarbeiter*innen des Forschungsbereiches „Medizinische Bioinformatik“ des MPC über umfangreiche Expertise und Erfahrungen mit der Entwicklung und Anwendung von Proteomik-Tools und -Ressourcen, der statistischen Analyse, sowie der Anwendung von Methoden des maschinellen Lernens. Hierbei liegt der Schwerpunkt vor allem auf klinischer und Human-Proteomik.
Es werden im Rahmen der wissenschaftlichen Infrastruktur-Facility CUBiMed.RUB Beratungs- und Analyse-Services angeboten, die Anwender*innen bei der bioinformatischen und statistischen Auswertung von Proteomik-Daten und dazugehörigen klinischen Daten unterstützen.
Wir bieten einen bioinformatischen Beratungsservice bezüglich der Anwendung unserer eigenen sowie fremder Proteomik-Software an. Wir beraten bei der Datenauswertung und der Auswahl geeigneter Softwaretools. Darüber hinaus entwickeln wir benutzerfreundliche Workflows für häufig benötigte Auswertungen und stellen diese zur Verfügung. Über die fachliche Beratung durch unsere Bioinformatiker*innen hinaus bieten wir auch an, die entsprechenden Analysen durchzuführen.
Unser Angebot umfasst unter anderem:
Wir unterstützen bei der Planung von Proteomik-Studien, bei der Auswahl geeigneter Analysemethoden und bei der Interpretation und Präsentation der erzielten Ergebnisse. Über die fachliche Beratung durch unsere Biostatistiker*innen hinaus bieten wir Ihnen auch an, die entsprechenden Analysen durchzuführen.
Unser Angebot umfasst unter anderem:
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Letzte Änderung: 30. Mai. 2023
